Grænseforeningen finansieres primært af kontingentmidler, renteindtægter og fondsmidler, herunder især fra Grænsefonden.

Foreningens indtægter er opdelt i to hovedgrupper – dels indtægter til særlige formål, dels indtægter til Grænseforeningens formål.

Indtægter til særlige formål er alt overvejende statsmidler, som er øremærket til en række organisationer i Sydslesvig (Dansk Centralbibliotek, Sydslesvigs danske Ungdomsforeninger, Sydslesvigsk Forening, Fælleslandboforeningen, Sydslesvigsk Vælgerforening og Sydslesvigsk Kultursamfund). Det modtagne beløb fra staten, som i de senere år har haft en størrelsesorden på ca. 90 mio. kr.) ekspederes videre til modtagerne i Sydslesvig. Baggrunden er, at det tidligere var kritisabelt, hvis den ene stat sendte pengemidler til en bestemt folkegruppe i en anden stat. Man kan således spørge, hvordan vi i Danmark ville reagere, hvis den tyrkiske stat begyndte at overføre store pengebeløb til danske statsborgere med tyrkisk sindelag. Dette volder dog ingen vanskeligheder i mellem Danmark og Tyskland og Grænseforeningens rolle som ”mellemmand” er derfor ophørt ved udgangen af 2009. Det understreges at Grænseforeningen aldrig har taget sig betalt for dette arbejde, hverken via honorar eller renteindtægter.

Øvrige indtægter til særlige formål er ligeledes båndlagte midler, som ikke vedrører Grænseforeningens drift, idet indtægter og udgifter til disse særlige formål balancerer med hinanden.

Indtægterne til Grænseforeningens formål er indtægter i foreningens almindelige driftsregnskab og udgifterne til Grænseforeningens formål er udgifterne i foreningens almindelige driftsregnskab.

Sidst i årsregnskabet er medtaget de ca. 50 fonde og legater, som Grænseforeningen administrerer.

Bemærk at Grænseforeningen ændrede sit regnskabsår i 2009, således at dette regnskabsåret for 2009 dækker perioden 1. april til 31. december. Herefter følger regnskabsåret kalenderåret.

Grænseforeningens årsregnskab 2006-07
Grænseforeningens årsregnskab 2007-08
Grænseforeningens årsregnskab 2008-09
Grænseforeningens årsregnskab 2009